Hola Ana.
En el siguiente enlace tienes como se instala y configura el Slic3r. Como ya lo tienes instalado ves directamente a la sección "Cómo cargar el fichero de configuración para la LION PRO 3D" y sigue el procedimiento que se indica. Además para asegurarte y de paso por si no los habías actualizado a la última versión, descargate de nuevo los perfiles.
http://tecnorobot.educa2.madrid.org/tecnologia/-/visor/instalacion-y-configuracion-del-slic3r
Correcto, puedes utilizar la versión del Slic3r que viene con el RepetierHost, además todavía no ha salido ninguna versión nueva del Slic3r por lo que la que viene con con el RepetierHost sigue siendo la última.
Me alegro que ya te funcione 8-)